专项审计是指具体到某一项的业务或某一方面的工作，专门对某一项业务进行的审计，专项审计的审计工作更加细化，更加专业化。
年度审计是对企业多方面的审计，具体项目也包括在内，专项审计调查，指审计机关主要采用审计的方法，对与财政收支、财务收支有关或者本级人民政府交办的特定事项，向有关地方政府、部门、单位和个人进行的专门调查活动。
相对于年度审计而言，专项审计调查具有以下特点：
1、目标的宏观性。由于专项审计调查是对经济领域中带全局性、普遍性、倾向性的特定事项进行系统调查了解，通过综合分析，向有关部门反映情况、揭露问题、提出解决问题的建议，为党委、政府决策提供依据，为国家宏观调控服务。因此专项审计调查的目标具有宏观性。
2、范围的广泛性。专项审计调查范围的广泛性主要体现在调查对象的广泛性和资料来源的广泛性两个方面。从对象上看，凡是与被调查事项有关的单位和个人都属于专项审计调查的范围。从资料来源上看，专项审计调查的证实材料既可以是从被调查单位的账册、报表中所收集的会计、统计数据，也可以是用调查走访有关人员等方式所收集的与被调查事项有关的其他资料。
3、方式的多样性。从严格意义上讲，专项审计调查是审计和调查的有机结合，因此审计人员可以采用多种方式来开展审计调查。专项审计调查既可以是单项调查，也可以是多项调查;既可以是单独的审计调查，也可以结合项目审计开展审计调查;既可以通过审核被调查单位的会计、统计资料进行调查，也可以通过召开座谈会和走访有关单位、个人，以及向有关单位、个人发放审计调查表等方式来进行调查。
4、作用的时效性。专项审计调查的目的是为上级经济决策提供依据，因此作出审计调查结论和提出审计调查建议必须要在上级有关部门作出决策之前，否则就会错过时机，使审计调查失去了应有的价值。